1971年时邪恶的修卡组织命令科学家百濑龙之介做实验将人类改造成怪物龙之介不愿再助纣为虐于是修卡组织利用龙之介释放出恶魔迪亚波罗后将其流放至宇宙龙之介意外通过黑洞穿梭至2071年的未来世界发现那时世界已经由恶魔迪亚波罗掌控为了拯救世界他使用回旋加速驱动器来到了2021年打算与自己的儿子秀夫合作对抗迪亚波罗但秀夫不愿原谅抛妻弃子的父亲局面陷入了僵持五十岚一辉神山飞羽真狩崎还有各位假面骑士纷纷挺身而出对抗邪恶势力秀夫最终也被亲情感化原谅了父亲龙之介父子俩成功变身为假面骑士世纪各位骑士穿梭于未来与现在为了守护世界而战迪亚波罗最终被消灭龙之介与秀夫间也不再有隔阂
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