二十世纪最后的夏天那一天人类终于知道自己并非地球这颗行星唯一的统治者巨型生物「怪兽」以及驱逐怪兽的终极存在「哥斯拉」出现了经历与怪兽之间长达半个世纪的战争人类屡战屡败最终计划逃出地球2048年经过中央政府管理的人工智能筛选一部分人类乘坐跨恒星移民飞船「阿拉特拉姆」号踏上了前往119光年之外的「鲸鱼座τ星e」的旅程然而人类花费20年所抵达的星球与地球之间的环境差距远超预期不适宜人类生存移民飞船上有一名青年晴雄4岁的时候他亲眼目睹父母被哥斯拉杀害20年来他始终想着回到地球消灭哥斯拉移民的可能性已经灰飞烟灭飞船内的生存环境也越发恶劣以晴雄为中心的「重返地球派」成为主流他们决定经过危险的长距离亚空间航行返回地球然而地球经过2万年的演化已经形成了以哥斯拉为顶端的生态体系完全成为了一个未知世界最终人类能否夺回地球晴雄的命运又将如何